在高温循环器恒温槽中，通过恒温槽内部的循环泵将热载体流动起来，热载体带走了加热器中产生的热量，向恒温槽中的样品传递热量，样品与热载体之间不断交换热量，最终达到热平衡状态，样品温度保持不变。同时，由于循环泵不断将热载体流动起来，恒温槽中温度也能够保持稳定。
当恒温槽中的样品温度和恒温槽的温度达到平衡时，样品温度将保持不变，这时可以根据样品的温度来控制加热器的温度，使加热器中产生的热量恰好与样品散发的热量相等，从而保持恒温槽中的温度平衡。
总之，高温循环器恒温槽内温度平衡的基本原理是利用恒温槽内部的热平衡原理，将样品和热载体之间的热量均匀分配，在恒温槽中达到稳定的温度平衡状态，从而实现对样品的恒温控制。